As fissuras labiopalatais geralmente tem seu tratamento iniciado pelo fechamento do lábio ocorrendo em cirurgia em torno dos 6 meses de idade. Já o palato tem seu fechamento em torno dos 12 meses. Geralmente são necessárias outras cirurgias, havendo numa grande maioria dos pacientes a reconstrução do rebordo alveolar a qual ocorre em torno dos 12 anos. Muitas vezes após o termino do crescimento facial poderá haver a necessidade de cirurgia ortognática.